Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm17333C6EQI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm17333C6EQI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm17333C6EQI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm17333C6EQI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm17333C6EQI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm17333C6EQI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm17333C6EQI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm17333C6EQI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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