Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef20B1ARV6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pramef20B1ARV6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pramef20B1ARV6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramef20B1ARV6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramef20B1ARV6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef20B1ARV6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramef20B1ARV6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef20B1ARV6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef20B1ARV6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramef20B1ARV6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramef20B1ARV6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms