Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itih4A6X935 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itih4A6X935 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itih4A6X935 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itih4A6X935 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itih4A6X935 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itih4A6X935 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itih4A6X935 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itih4A6X935 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms