Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec16aA2AIX1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec16aA2AIX1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec16aA2AIX1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec16aA2AIX1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec16aA2AIX1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec16aA2AIX1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec16aA2AIX1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec16aA2AIX1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec16aA2AIX1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sec16aA2AIX1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec16aA2AIX1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec16aA2AIX1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec16aA2AIX1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec16aA2AIX1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sec16aA2AIX1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec16aA2AIX1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec16aA2AIX1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms