Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Itgb4A2A863 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Itgb4A2A863 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Itgb4A2A863 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Itgb4A2A863 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Itgb4A2A863 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,81■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Itgb4A2A863 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Itgb4A2A863 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Itgb4A2A863 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Itgb4A2A863 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Itgb4A2A863 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Itgb4A2A863 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Itgb4A2A863 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Itgb4A2A863 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Itgb4A2A863 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Itgb4A2A863 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Itgb4A2A863 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Itgb4A2A863 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
Itgb4A2A863 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Itgb4A2A863 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Itgb4A2A863 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Itgb4A2A863 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Itgb4A2A863 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Itgb4A2A863 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Itgb4A2A863 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Itgb4A2A863 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Itgb4A2A863 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Itgb4A2A863 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31,45■■■□□ 2,62
Itgb4A2A863 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Itgb4A2A863 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Itgb4A2A863 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Itgb4A2A863 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Itgb4A2A863 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Itgb4A2A863 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Itgb4A2A863 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Itgb4A2A863 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,19■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Itgb4A2A863 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31,12■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Itgb4A2A863 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms