Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ24

Gm21858, Predicted gene, 21858, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21858A0A087WQ24 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21858A0A087WQ24 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21858A0A087WQ24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21858A0A087WQ24 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21858A0A087WQ24 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21858A0A087WQ24 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21858A0A087WQ24 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21858A0A087WQ24 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21858A0A087WQ24 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21858A0A087WQ24 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21858A0A087WQ24 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21858A0A087WQ24 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21858A0A087WQ24 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms