Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28919A0A087WP35 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28919A0A087WP35 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28919A0A087WP35 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28919A0A087WP35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28919A0A087WP35 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28919A0A087WP35 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm28919A0A087WP35 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28919A0A087WP35 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28919A0A087WP35 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm28919A0A087WP35 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm28919A0A087WP35 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28919A0A087WP35 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28919A0A087WP35 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms