Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms