Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPQQ9Y646 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPQQ9Y646 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPQQ9Y646 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms