Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPRBQ9Y5M8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPRBQ9Y5M8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms