Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AFG3L2Q9Y4W6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2Q9Y4W6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFG3L2Q9Y4W6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms