Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP3Q9Y3E7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP3Q9Y3E7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms