Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FAN1Q9Y2M0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAN1Q9Y2M0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms