Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC3Q9UQE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC3Q9UQE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms