Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PNMA8BQ9ULN7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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