Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HERC5Q9UII4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC5Q9UII4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms