Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms