Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL13Q9P2N7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL13Q9P2N7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms