Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms