Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MIS18AQ9NYP9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIS18AQ9NYP9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms