Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMP3Q9NV31 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP3Q9NV31 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms