Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF3Q9NUQ8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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