Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM106BQ9NUM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM106BQ9NUM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms