Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS2Q9NRF8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTPS2Q9NRF8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms