Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX1Q9NRD9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX1Q9NRD9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms