Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NRIP3Q9NQ35 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms