Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCDH12Q9NPG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCDH12Q9NPG4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms