Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD248Q9HCU0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms