Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCAD1Q9H4L7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCAD1Q9H4L7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms