Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00597Q9H2U6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00597Q9H2U6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms