Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CEP44Q9C0F1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CEP44Q9C0F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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