Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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