Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIPCQ9C0C6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms