Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GSDMCQ9BYG8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms