Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms