Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PBDC1Q9BVG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PBDC1Q9BVG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms