Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MESP1Q9BRJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms