Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SrrtQ99MR6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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