Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC5LQ99459 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC5LQ99459 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC5LQ99459 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms