Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP2Q96SN8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms