Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
IFT140Q96RY7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
IFT140Q96RY7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IFT140Q96RY7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms