Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM87BQ96K49 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM87BQ96K49 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.4 ms