Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BICD1Q96G01 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BICD1Q96G01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BICD1Q96G01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms