Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RMDN1Q96DB5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RMDN1Q96DB5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms