Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RFT1Q96AA3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms