Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP7Q93009 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP7Q93009 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP7Q93009 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP7Q93009 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
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USP7Q93009 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP7Q93009 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP7Q93009 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP7Q93009 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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