Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF7Q92985 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF7Q92985 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF7Q92985 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF7Q92985 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRF7Q92985 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF7Q92985 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF7Q92985 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms