Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF397Q8NF99 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF397Q8NF99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms