Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC21AQ8NDW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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