Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC89Q8N998 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC89Q8N998 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms